Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX3Q13761 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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