Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1SQ13698 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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