Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEUROD1Q13562 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
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