Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATRQ13535 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ATRQ13535 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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