Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TOP3AQ13472 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TOP3AQ13472 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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