Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKP2Q13309 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms