Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLAMF1Q13291 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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