Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RIGQ13278 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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