Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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SEMA3FQ13275 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
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SEMA3FQ13275 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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SEMA3FQ13275 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3FQ13275 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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