Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHAF1BQ13112 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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