Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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