Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACACAQ13085 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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