Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PTP4A2Q12974 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTP4A2Q12974 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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