Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB40BQ12829 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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RAB40BQ12829 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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RAB40BQ12829 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB40BQ12829 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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