Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SREBF2Q12772 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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