Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms