Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms