Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPOCK1Q08629 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms