Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCL9Q07325 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCL9Q07325 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms