Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms