Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP1Q04837 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms