Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
OCA2Q04671 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms