Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARID5AQ03989 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARID5AQ03989 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms