Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRX3P78415 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms