Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CSNK2A1P68400 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms