Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63132 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63132 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms