Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ARF6P62330 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ARF6P62330 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ARF6P62330 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF6P62330 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF6P62330 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ARF6P62330 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms