Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNAP25P60880 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms