Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK1P57059 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK1P57059 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK1P57059 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK1P57059 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms