Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME5P56597 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NME5P56597 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME5P56597 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME5P56597 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME5P56597 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms