Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK1EP49674 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms