Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMPHP49418 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMPHP49418 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMPHP49418 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMPHP49418 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMPHP49418 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMPHP49418 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms