Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI2P48788 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms