Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms