Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP8P40818 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP8P40818 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP8P40818 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP8P40818 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP8P40818 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP8P40818 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP8P40818 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP8P40818 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP8P40818 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP8P40818 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP8P40818 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms