Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR2P36980 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR2P36980 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR2P36980 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR2P36980 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFHR2P36980 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CFHR2P36980 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms