Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LTBRP36941 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LTBRP36941 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms