Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP5C1P36542 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP5C1P36542 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms