Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP6P35125 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP6P35125 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP6P35125 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP6P35125 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP6P35125 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP6P35125 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP6P35125 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP6P35125 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP6P35125 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP6P35125 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP6P35125 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP6P35125 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms