Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC1P33527 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC1P33527 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC1P33527 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC1P33527 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC1P33527 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC1P33527 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms