Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BRS3P32247 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BRS3P32247 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms