Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXC12P31275 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms