Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA9P31269 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA9P31269 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms