Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC27P30260 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC27P30260 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC27P30260 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC27P30260 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC27P30260 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC27P30260 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC27P30260 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC27P30260 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC27P30260 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms