Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD40LGP29965 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms