Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLD1P28340 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLD1P28340 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLD1P28340 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLD1P28340 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLD1P28340 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLD1P28340 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLD1P28340 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
POLD1P28340 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLD1P28340 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms