Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms