Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNTFRP26992 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CNTFRP26992 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNTFRP26992 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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