Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO2P25791 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO2P25791 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO2P25791 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO2P25791 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO2P25791 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO2P25791 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms