Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms